Evaluation von HMG-CoA und weiteren Liganden als potenzielle Interaktionspartner muriner Lipocaline mittels In-silico-Methoden und Microscale Thermophorese (MST)
- Beschreibung
Die Major Urinary Proteins (MUPs) sind Mausproteine aus der Familie der Lipocaline. Obwohl sie vor allem für ihre Fähigkeit bekannt sind, Pheromone zu binden und zu transportieren, könnten die MUPs auch mit anderen lipophilen Verbindungen interagieren. Dies deutet darauf hin, dass MUPs möglicherweise auch eine bislang wenig untersuchte Rolle im Lipidstoffwechsel spielen. Dieses Projekt hat zum Ziel, neue Liganden von MUP zu charakterisieren und bislang unbekannte Interaktionspartner zu identifizieren, wie z.B. HMG-CoA [3-Hydroxy-3-Methylglutaryl-Coenzym-A], sowie verschiedene Fettsäuren und Gallensäuren.
Das Projekt bietet die Möglichkeit, praktische Erfahrungen mit der Microscale Thermophorese (MST) zur Untersuchung von Protein-Ligand-Interaktionen in vitro zu sammeln. Ergänzend dazu werden Einblicke in computergestützte Methoden zur Vorhersage und Bewertung von Protein-Ligand-Interaktionen vermittelt. Die dadurch gewonnenen Erkenntnisse können zu einem besseren Verständnis der biologischen Funktionen von MUPs beitragen und neue Einblicke in die Interpretation präklinischer Mausmodelle für metabolische Erkrankungen wie die metabolische Dysfunktion-assoziierte steatotische Lebererkrankung (MASLD), Typ-2-Diabetes und Adipositas ermöglichen.
Aufgaben
- Einarbeitung in die Grundlagen von Protein-Ligand-Interaktionen
- Herstellung und Handhabung von Protein- und Ligandenlösungen
- Durchführung von Messungen mittels Microscale Thermophorese (MST)
- Auswertung von MST-Daten und Bestimmung von Bindungsaffinitäten (Kd-Werten)
- Vergleich und Interpretation der Bindungsaffinitäten verschiedener Lipidverbindungen
- Ergänzende Untersuchung und Interpretation der Protein-Ligand-Interaktionen mithilfe von In-silico-Methoden
- Einführung in In-silico-Werkzeuge zur Analyse relevanter Stoffwechselwege und zur Einordnung der untersuchten Liganden in ihren metabolischen Kontext
- Dokumentation, wissenschaftliche Auswertung und Präsentation der Ergebnisse
- Projektzeitraum
- Wintersemester 2026/2027
- Bewerbungszeitraum
- 12. bis 26.10.2026
- Durchführung
- nach Absprache
- Details zu Projektzeitraum und Durchführung
Projektdauer: November 2026-Januar 2027
Bewerbungsfrist: 12-26 Oktober 2026
Zeitplan: Während des gesamten Semesters oder in einem vereinbarten Block
Der genaue Zeitplan (Startdatum, Aufteilung der Arbeitsphasen) wird individuell zwischen den Betreuern und den Teilnehmern vereinbart. Die praktischen Arbeiten können je nach Verfügbarkeit von Geräten und Proben flexibel organisiert werden.
- Studienfach
-
Biologie
Ernährungswissenschaft
Lebensmittelwissenschaft und Biotechnologie
Medizinische Ernährungswissenschaft
Molekulare Ernährungswissenschaft - Betreuende
- Diana Mollocana Yanez, Prof. Dr. Katrin Giller
- Institut
- Institut für Ernährungswissenschaften (140) ( Molekulare Ernährungswissenschaft (140a))
- Sprache
- deutsch/englisch
- Teilnehmendenanzahl
- min. 1, max. 1
- Arbeitsaufwand
-
ca. 120 Stunden pro Teilnehmende:r
| 4
ECTS-Punkte
Arbeitsaufwand (Stunden und ggf. ECTS) sind ungefähre Angaben. Die tatsächlich vergebenen ECTS-Punkte ergeben sich aus der tatsächlich geleisteten Arbeit.
- Für dieses Projekt ist kein Motivationsschreiben des Studierenden erforderlich
- Projektart
- experimentell
- Lernziele
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Die Teilnehmende lernen in diesem Projekt:
- ein wissenschaftliches Forschungsprojekt im Bereich der Protein-Ligand-Wechselwirkungen kennen.
- gezielt wissenschaftliche Literatur zu Lipocalinen und lipidbasierten Liganden zu recherchieren und einzuordnen.
- die Grundlagen biophysikalischer Methoden zur Bestimmung von Bindungsaffinitäten zu verstehen und anzuwenden.
- unter fachlicher Anleitung MST-Experimente vorzubereiten und durchzuführen und dabei praktische Erfahrungen zu sammeln.
- experimentelle Bindungsdaten zu analysieren und wissenschaftlich zu interpretieren.
- Messdaten mit geeigneten Methoden zu verarbeiten und grafisch darzustellen.
- wissenschaftliche Ergebnisse mündlich und schriftlich zu präsentieren.
- Anmerkungen für Studierende
Es sind keine spezifischen Vorkenntnisse zur MST erforderlich. Grundkenntnisse in Biochemie und Interesse an experimenteller und Informatik Arbeit sind hilfreich. Während des Projekts erfolgt eine systematische Einführung in die Methode und die theoretischen Grundlagen.
- Schlagworte
- Protein-Ligand-Wechselwirkungen, MUP, Lipokaline, Lipide, HMG-CoA, Cholesterinstoffwechsel, Microscale Thermophorese (MST), In-Vitro Analyse