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Gezielte Genomänderung mit CRISPR/Cas9: ‚quick and dirty’

Beschreibung

Änderungen des Genoms, also Mutationen, sind zufällig, sofern sie durch Strahlung, Chemikalien oder biologische Mutagenzien ausgelöst werden. Klassische Genetik und Züchtungsforschung beruhen auf der Sammlung solcher Mutanten, die aufgrund ihrer besonderen Merkmale aufgefallen sind. Die Sequenzierung von Genomen verschiedener Organismen erlaubt den Zugang zu unbekannten Genen. Es wurden bereits diverse Methoden zur Genmanipulation entwickelt. Ganz neu und sehr viel versprechend ist das CRISPR/Cas9 System, denn es erlaubt die zielgenaue Mutation von Genen im Wunschorganismus, z.B. auch in Drosophila melanogaster. Damit lässt sich im Prinzip jedes Gen nach Belieben gezielt verändern.

Lernen Sie das CRISPR/Cas9 System kennen, seine Anwendungsmöglichkeiten und seine Beschränkungen! Nach dem Design von CRISPR-Primern, werden Sie selbst Drosophila Embryonen injizieren, und mutierte Fliegenstämme genotypisieren.

Projektzeitraum
Wintersemester 2018/2019 und Sommersemester 2019
Bewerbungszeitraum
15. bis 23.10.2018
Durchführung
nach Absprache
Details zu Projektzeitraum und Durchführung

Nach einer theoretischen Einarbeitungszeit schließt sich eine Laborphase an, die mehrere Nachmittage umfasst. Termin nach Absprache, am besten in der vorlesungsfreien Zeit

Studienfach
Biologie
Agrarbiologie
Ernährungswissenschaft
Betreuende
Prof. Dr. Anette Preiss
Institut
(Allgemeine Genetik (240A))
Sprache
deutsch/englisch
Teilnehmendenanzahl
min. 1, max. 2
Arbeitsaufwand
ca. 120 Stunden pro Teilnehmende:r | 4 ECTS-Punkte

Arbeitsaufwand (Stunden und ggf. ECTS) sind ungefähre Angaben. Die tatsächlich vergebenen ECTS-Punkte ergeben sich aus der tatsächlich geleisteten Arbeit.

 
Für dieses Projekt ist kein Motivationsschreiben des Studierenden erforderlich
Projektart
experimentell
Lernziele

Die Teilnehmende lernen in diesem Projekt:

Theorie:

Warum Genmanipulation? Welche Art von Mutationen ist erwünscht? Welchen Sinn machen welche Mutanten (z.B. regulatorisch, Fehlsinn, Spleißvariante, Nullmutante), was lässt sich damit erforschen, und wie lassen sie sich designen?

Herkunft und ursprüngliche Funktion des CRISPR/Cas9 Systems; Ablauf des Mechanismus in Bakterien. Voraussetzungen für die Anwendung des CRISPR/Cas9 Systems in eukaryontischen Zellen; Studiendesign in Drosophila. Mechanismen der DNA-Doppelstrangbruch-Reparatur.

Strategien zur Durchführung einer in vitro Mutagenese und Nachweis erfolgreicher Mutanten.

Praxis:

  • Zielsequenzsuche und Design einer chi-RNA
  • Injektion von Drosophila-Embryonen mit chi-RNA
  • PCR-Nachweis mutanter vs. Kontroll-Fliegenstämmen
  • Agarosegel-Elektrophorese & Auswertung der PCR
Anmerkungen für Studierende

Dieses Projekt richtet sich an alle, die sich für molekulare Genetik, medizinische Fragestellungen und Gene-editing interessieren und praktisch im Labor arbeiten wollen.

Schlagworte
Molekularbiologie, CRISPR/Cas9, in vitro Mutagenese, Genome Engineering, Genmanipulation