Transformation von Rostpilzen – Wir schießen scharf!
- Beschreibung
Rostpilze stellen eine wichtige Gruppe von biotrophen Krankheitserregern an Nutzpflanzen dar. Bedingt durch ihre biotrophe Lebensweise müssen Rostpilze Ihren Wirt am Leben halten bis ihr Lebenszyklus abgeschlossen ist. Um dies zu ermöglichen treten Rostpilze in eine intensive Interaktion mit der Wirtspflanze um von dieser Nährstoffe entziehen zu können und gleichzeitig die pflanzlichen Abwehrmechanismen zu unterdrücken. Für die Erforschung dieser Interaktion ist es essentiell den Pilz genetisch transformieren zu können. Ziel des Humboldt-Projektes ist es ein bakterielles Enzym, eine Transposase, nutzbar zu machen um die Transformation des Rostpilzes zu bewerkstelligen. Diese Enzyme sind in der Lage ein bestimmtes DNA Fragment zu binden und selbständig in das pilzliche Genom einzubauen. Im Rahmen des Projektes sollen rekombinante Varianten des Enzyms aus Bakterien gereinigt, analysiert und letztlich mittels Gene Gun / Particle Bombarment in den Pilz eingeführt werden.
- Projektzeitraum
- Wintersemester 2014/15
- Bewerbungszeitraum
- 18. bis 26.10.2014
- Durchführung
- nach Absprache
- Details zu Projektzeitraum und Durchführung
Abweichend hiervon kann der genaue Zeitraum im Rahmen der Vorbesprechung (am besten am 1.4.2014 ) besprochen werden.
Ein geblockter Verlauf oder ein Projektbeginn im Wintersemester 13/14 ist ebenfalls möglich.
- Studienfach
-
Agrarbiologie
Agrarwissenschaften
Biologie - Betreuende
- Dr. rer. nat. Christian Seibel, Alexandra Rehfus
- Institut
- Institut für Phytomedizin (360) (Phytopathologie)
- Sprache
- deutsch
- Teilnehmendenanzahl
- min. 1, max. 2
- Arbeitsaufwand
-
ca. 150 Stunden pro Teilnehmende:r
| 4
ECTS-Punkte
Arbeitsaufwand (Stunden und ggf. ECTS) sind ungefähre Angaben. Die tatsächlich vergebenen ECTS-Punkte ergeben sich aus der tatsächlich geleisteten Arbeit.
- Für dieses Projekt ist kein Motivationsschreiben des Studierenden erforderlich
- Projektart
- experimentell
- Lernziele
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Die Teilnehmende lernen in diesem Projekt:
Einblick in die Biologie der biotrophen Rostpilze im Hinblick auf Etablierung der Biotrophie.
Methoden:Grundlegende Methoden der Molekularbiologie und Biochemie. Im besonderen: Überexpression von rekombinaten Proteinen in E. coli. Proteinreinigung mittels Ni-NTA Affinitätschromatographie. SDS-PAGE, Plasmid Präparation, Restriktionsverdau.
Darüber hinaus: in vitro Tests zu DNA Binde- und Integrationseigenschaften rekombinanter Transposasen wie z.B. Gel-Shift Assays; Transformation des Ackerbohnenrostes Uromyces fabae mittels Gene Gun.
- Anmerkungen für Studierende
Das Projekt richtet sich an Studierende mit Interesse an der Phytopathologie und Molekularbiologie.
Es bietet die Möglichkeit das Arbeiten im wissenschaftlichen Labor kennzulernen, Faszination für die Molekularbiologie zu entdecken und Standartmethoden als Vorbereitung für eine Bachelor /Masterarbeit zu erlernen.